L'ecografia di 2° livello non è un'ecografia di screening ovvero un’ecografia standard, bensì un esame su indicazione, cioè volto a risolvere un quesito specifico.
Le indicazioni per un’ecografia di secondo livello possono essere:

• Sospetto di anomalia fetale durante un’ecografia di screening del 1°2°3° trimestre
• Elevato valore di NT o soft markers
• Sospetto sospetto difetto o eccesso di crescita fetale
• Riduzione o eccesso di liquido amniotico: ani/oligoidramnios, polidramnios
  
• Assunzione di farmaci teratogeni in gravidanza
  
• Infezione in gravidanza
• Alcune patologie materne, ad esempio il diabete insulino-dipendente
• Rischio anamnestico per malformazione come precedente nato con malformazione
  
• Elevato valore alfa-fetoproteina
• Gravidanza multipla
  
• Cromosomopatie
• Sospetta anomalie della placenta, membrane o cordone
• Grande obesità